MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20

Total Repeats: 34530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010471	ACCAA	2	10	350	359	60 %	0 %	0 %	40 %	170016359
2	NC_010471	TA	3	6	434	439	50 %	50 %	0 %	0 %	170016359
3	NC_010471	ATT	2	6	476	481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016359
4	NC_010471	CTG	2	6	492	497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016359
5	NC_010471	ATC	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016359
6	NC_010471	TTA	2	6	582	587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016359
7	NC_010471	TGT	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016359
8	NC_010471	TTAT	2	8	783	790	25 %	75 %	0 %	0 %	170016359
9	NC_010471	GGT	2	6	791	796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016359
10	NC_010471	ACG	2	6	851	856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016359
11	NC_010471	CAG	2	6	882	887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016359
12	NC_010471	CGG	2	6	939	944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170016359
13	NC_010471	AAGA	2	8	950	957	75 %	0 %	25 %	0 %	170016359
14	NC_010471	TTA	2	6	977	982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016359
15	NC_010471	TGA	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016359
16	NC_010471	AAG	2	6	1023	1028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016359
17	NC_010471	T	6	6	1031	1036	0 %	100 %	0 %	0 %	170016359
18	NC_010471	CAAA	2	8	1066	1073	75 %	0 %	0 %	25 %	170016359
19	NC_010471	TTA	2	6	1074	1079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016359
20	NC_010471	TTG	2	6	1107	1112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016359
21	NC_010471	AGGC	2	8	1143	1150	25 %	0 %	50 %	25 %	170016359
22	NC_010471	A	6	6	1201	1206	100 %	0 %	0 %	0 %	170016359
23	NC_010471	ATG	2	6	1239	1244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016359
24	NC_010471	ATTG	2	8	1252	1259	25 %	50 %	25 %	0 %	170016359
25	NC_010471	CAA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016359
26	NC_010471	CAA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016359
27	NC_010471	TGA	2	6	1456	1461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016359
28	NC_010471	A	6	6	1481	1486	100 %	0 %	0 %	0 %	170016359
29	NC_010471	TGG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016359
30	NC_010471	TCAT	2	8	1582	1589	25 %	50 %	0 %	25 %	170016359
31	NC_010471	TAC	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016359
32	NC_010471	CAAC	2	8	1602	1609	50 %	0 %	0 %	50 %	170016359
33	NC_010471	A	6	6	1678	1683	100 %	0 %	0 %	0 %	170016359
34	NC_010471	ATG	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016360
35	NC_010471	TCA	2	6	1942	1947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016360
36	NC_010471	CAA	2	6	1952	1957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016360
37	NC_010471	ACA	2	6	2062	2067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016360
38	NC_010471	CATTA	2	10	2097	2106	40 %	40 %	0 %	20 %	170016360
39	NC_010471	TGA	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016360
40	NC_010471	GAT	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016360
41	NC_010471	GCA	2	6	2287	2292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016360
42	NC_010471	ATT	2	6	2305	2310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016360
43	NC_010471	CAAA	2	8	2314	2321	75 %	0 %	0 %	25 %	170016360
44	NC_010471	CATT	2	8	2364	2371	25 %	50 %	0 %	25 %	170016360
45	NC_010471	ACA	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016360
46	NC_010471	ATT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016360
47	NC_010471	ACA	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016360
48	NC_010471	AG	3	6	2646	2651	50 %	0 %	50 %	0 %	170016360
49	NC_010471	AAC	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016360
50	NC_010471	AAG	2	6	2789	2794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016360
51	NC_010471	AAG	2	6	2807	2812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016360
52	NC_010471	ATA	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016360
53	NC_010471	AT	3	6	3182	3187	50 %	50 %	0 %	0 %	170016361
54	NC_010471	CA	3	6	3194	3199	50 %	0 %	0 %	50 %	170016361
55	NC_010471	GAA	2	6	3210	3215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016361
56	NC_010471	ATT	2	6	3219	3224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016361
57	NC_010471	GCAA	2	8	3236	3243	50 %	0 %	25 %	25 %	170016361
58	NC_010471	TAT	2	6	3268	3273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016361
59	NC_010471	AAG	2	6	3303	3308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016361
60	NC_010471	TAT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016361
61	NC_010471	AATT	2	8	3379	3386	50 %	50 %	0 %	0 %	170016361
62	NC_010471	TGC	2	6	3389	3394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016361
63	NC_010471	AAG	2	6	3397	3402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016361
64	NC_010471	GCA	3	9	3417	3425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016361
65	NC_010471	A	7	7	3429	3435	100 %	0 %	0 %	0 %	170016361
66	NC_010471	TGA	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016361
67	NC_010471	AGC	3	9	3467	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016361
68	NC_010471	GTC	2	6	3547	3552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016361
69	NC_010471	TAA	3	9	3569	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016361
70	NC_010471	GCAAG	2	10	3697	3706	40 %	0 %	40 %	20 %	170016362
71	NC_010471	GC	3	6	3743	3748	0 %	0 %	50 %	50 %	170016362
72	NC_010471	AGT	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016362
73	NC_010471	TTAA	2	8	3776	3783	50 %	50 %	0 %	0 %	170016362
74	NC_010471	A	8	8	3821	3828	100 %	0 %	0 %	0 %	170016362
75	NC_010471	A	6	6	3872	3877	100 %	0 %	0 %	0 %	170016362
76	NC_010471	TTATT	2	10	3936	3945	20 %	80 %	0 %	0 %	170016362
77	NC_010471	TCG	3	9	3988	3996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016362
78	NC_010471	ACA	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016362
79	NC_010471	AAAC	2	8	4106	4113	75 %	0 %	0 %	25 %	170016362
80	NC_010471	AGC	3	9	4210	4218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016362
81	NC_010471	GCA	2	6	4331	4336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016362
82	NC_010471	TGA	2	6	4399	4404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016362
83	NC_010471	ATG	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016362
84	NC_010471	CAA	2	6	4457	4462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016362
85	NC_010471	ACA	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016362
86	NC_010471	TTA	2	6	4535	4540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016362
87	NC_010471	GAT	2	6	4544	4549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016362
88	NC_010471	GCC	2	6	4572	4577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170016362
89	NC_010471	CTT	2	6	4632	4637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016362
90	NC_010471	AAGCA	2	10	4710	4719	60 %	0 %	20 %	20 %	170016362
91	NC_010471	GAA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016363
92	NC_010471	AAT	3	9	4769	4777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016363
93	NC_010471	GAT	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016363
94	NC_010471	ACA	2	6	4934	4939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016363
95	NC_010471	CAT	2	6	4952	4957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016363
96	NC_010471	TTG	2	6	4971	4976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016363
97	NC_010471	TGA	2	6	4987	4992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016363
98	NC_010471	TGA	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016363
99	NC_010471	TGG	2	6	5143	5148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016363
100	NC_010471	TGG	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016363
101	NC_010471	TGG	2	6	5179	5184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016363
102	NC_010471	GTT	2	6	5207	5212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016363
103	NC_010471	TAT	2	6	5264	5269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016363
104	NC_010471	CAA	2	6	5325	5330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016363
105	NC_010471	AAC	2	6	5383	5388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016363
106	NC_010471	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016363
107	NC_010471	GTT	2	6	5558	5563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016363
108	NC_010471	GAA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016363
109	NC_010471	ACA	2	6	5630	5635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016363
110	NC_010471	AC	3	6	5693	5698	50 %	0 %	0 %	50 %	170016363
111	NC_010471	AGAA	2	8	5747	5754	75 %	0 %	25 %	0 %	170016363
112	NC_010471	ATG	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016363
113	NC_010471	GCAAA	2	10	5957	5966	60 %	0 %	20 %	20 %	170016363
114	NC_010471	GC	3	6	5996	6001	0 %	0 %	50 %	50 %	170016363
115	NC_010471	AGC	2	6	6004	6009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016363
116	NC_010471	GC	3	6	6017	6022	0 %	0 %	50 %	50 %	170016363
117	NC_010471	ATA	2	6	6081	6086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016363
118	NC_010471	TTAT	2	8	6113	6120	25 %	75 %	0 %	0 %	170016363
119	NC_010471	CGG	2	6	6139	6144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170016363
120	NC_010471	GAA	2	6	6159	6164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016363
121	NC_010471	GAA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016363
122	NC_010471	GAT	2	6	6293	6298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016363
123	NC_010471	CA	3	6	6363	6368	50 %	0 %	0 %	50 %	170016363
124	NC_010471	ATT	2	6	6376	6381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016363
125	NC_010471	ACC	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016363
126	NC_010471	AGA	2	6	6514	6519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016363
127	NC_010471	TCG	2	6	6628	6633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016363
128	NC_010471	TTA	2	6	6635	6640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016363
129	NC_010471	AGC	2	6	6664	6669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016363
130	NC_010471	TGA	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016363
131	NC_010471	CGT	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016363
132	NC_010471	TCG	2	6	6744	6749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016363
133	NC_010471	CAT	2	6	6910	6915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016364
134	NC_010471	TTG	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016364
135	NC_010471	TCG	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016364
136	NC_010471	GTGAT	2	10	7066	7075	20 %	40 %	40 %	0 %	170016364
137	NC_010471	TGGA	2	8	7162	7169	25 %	25 %	50 %	0 %	170016364
138	NC_010471	GC	3	6	7227	7232	0 %	0 %	50 %	50 %	170016364
139	NC_010471	ATG	2	6	7300	7305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016364
140	NC_010471	GAA	2	6	7308	7313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016364
141	NC_010471	TTA	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016364
142	NC_010471	TGA	2	6	7444	7449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016364
143	NC_010471	TGG	2	6	7511	7516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016364
144	NC_010471	TCG	2	6	7541	7546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016364
145	NC_010471	TGGGCG	2	12	7559	7570	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	170016364
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147	NC_010471	ATT	2	6	7626	7631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016364
148	NC_010471	GATT	2	8	7666	7673	25 %	50 %	25 %	0 %	170016364
149	NC_010471	AAT	2	6	7803	7808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016364
150	NC_010471	TTA	2	6	7824	7829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016364
151	NC_010471	CAAA	2	8	7830	7837	75 %	0 %	0 %	25 %	170016364
152	NC_010471	TGG	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016364
153	NC_010471	CTTA	2	8	7909	7916	25 %	50 %	0 %	25 %	170016364
154	NC_010471	TCG	3	9	7937	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016364
155	NC_010471	ATT	2	6	8037	8042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016364
156	NC_010471	TGAT	2	8	8080	8087	25 %	50 %	25 %	0 %	170016364
157	NC_010471	GCAA	2	8	8114	8121	50 %	0 %	25 %	25 %	170016364
158	NC_010471	ATT	2	6	8250	8255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016364
159	NC_010471	ATG	2	6	8257	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016364
160	NC_010471	CAAA	2	8	8277	8284	75 %	0 %	0 %	25 %	170016364
161	NC_010471	TGAAGA	2	12	8336	8347	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170016364
162	NC_010471	TTGA	2	8	8349	8356	25 %	50 %	25 %	0 %	170016364
163	NC_010471	AGA	3	9	8357	8365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016364
164	NC_010471	GTG	2	6	8437	8442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016364
165	NC_010471	GTG	2	6	8446	8451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016364
166	NC_010471	ATG	2	6	8470	8475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016364
167	NC_010471	CTT	2	6	8525	8530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016364
168	NC_010471	TAA	2	6	8534	8539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016364
169	NC_010471	GTT	2	6	8607	8612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016364
170	NC_010471	TTA	2	6	8616	8621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016364
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172	NC_010471	GTG	2	6	8665	8670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016364
173	NC_010471	ACT	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016364
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176	NC_010471	TCAG	2	8	8865	8872	25 %	25 %	25 %	25 %	170016364
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261	NC_010471	TGGT	2	8	13822	13829	0 %	50 %	50 %	0 %	170016371
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